La Koïnonia est active en Suisse depuis l’année 2012 lorsque le p. Olivier Bagnoud a commencé des activités d’évangélisation à Fribourg, à Zurich et en Valais. A travers des messes de guérison et des rencontres d’évangélisation de nombreuses personnes ont été touchées, ont rencontré Jésus ressuscité et fait l’expérience de l’Amour du Père et de l’effusion du Saint Esprit. Les retraites de formation données en Suisse ont permis de former des évangélisateurs qui se réunissent chaque semaine dans des maisons de prière où ils invitent de nouvelles personnes afin qu’elles rencontrent à leur tour Jésus vivant et présent au milieu de son peuple qui le loue. Et ainsi les activités de la Koïnonia en Suisse se sont développées progressivement à Fribourg, Zurich, Genève, Villeneuve et Estavayer-le-Lac.
Au mois d’octobre 2018 l’évêque de Genève, Lausanne et Fribourg, Mgr Charles Morerod, a accueilli officiellement la Koïnonia Jean-Baptiste, nous invitant à développer notre présence et nos activités d’évangélisation dans le diocèse. En réponse à cette invitation, une petite communauté de vie consacrée de la Koïnonia Jean-Baptiste s’est installée au mois de septembre 2019 dans le canton de Fribourg à la cure de Semsales, où vivent un prêtre, un frère consacré et 2 sœurs consacrées de la communauté.